O Conselho de Gestão é o órgão colegial que conduz a gestão administrativa, patrimonial e financeira da Universidade, bem como a gestão dos seus recursos humanos. O órgão é designado e presidido pelo Reitor, sendo composto por cinco membros, incluindo um vice-reitor e o administrador.

A convite do Reitor, podem participar nas reuniões, sem direito a voto, outros elementos da equipa reitoral, responsáveis de unidades alunos ou demais membros da comunidade académica, sempre que as matérias o justificarem.