O Senado Académico é o órgão consultivo que assegura a coesão da Universidade na prossecução da sua missão, com funções de coordenação, prospectiva e planeamento em matérias pedagógicas e científicas além do âmbito das unidades orgânicas.

Tem a seguinte composição: reitor (que preside), presidentes das unidades orgânicas, responsáveis dos conselhos pedagógicos das unidades orgânicas; presidente do Conselho Cultural, presidente da AAUM, administrador da Universidade, administrador dos Serviços de Acção Social; um estudante por cada Conselho Pedagógico das unidades orgânicas; três representantes dos professores e investigadores doutorados; três representantes dos estudantes; e dois representantes do pessoal não docente e não investigador.