O curso pretende criar uma oferta formativa na área da Engenharia Sanitária. É vocacionado para a transmissão de conhecimentos avançados nos domínios específicos da hidráulica urbana e da sua ligação com a saúde pública. Estas duas temáticas apresentam, uma forte ligação a várias outras, relacionadas com a operação, conservação e reabilitação das infraestruturas dos sistemas hidráulicos urbanos, com a gestão da água e sustentabilidade dos sistemas dos serviços de água. Pretende-se, com este curso, dotar os alunos de conhecimentos teóricos avançados, que sejam úteis do ponto de vista da sua aplicação prática e que constituam uma mais-valia significativa em relação aos conteúdos tradicionalmente lecionados em cursos de mestrado integrado. Pretende-se ainda transmitir, conhecimentos avançados nos tópicos da modelação, da gestão, operação e manutenção de infraestruturas e equipamentos e dos processos e tecnologias de tratamento de águas.
O curso encontra-se estruturado em três semestres letivos, cada um com 30 ECTS. O primeiro semestre será constituído por um tronco comum obrigatório, com 10 unidades curriculares de 3 ECTS cada. O segundo semestre divide-se em 2 ramos, cada um deles constituído por uma unidade curricular de 3 ECTS comum e obrigatória, 6 unidades curriculares de 3 ECTS, específica de cada ramo, e, ainda, por 3 unidades curriculares opcionais de 3 ECTS. O terceiro semestre é inteiramente dedicado à elaboração da dissertação, correspondente a uma unidade curricular de 30 ECTS. As unidades opcionais podem ser escolhidas a partir de um conjunto de disciplinas disponibilizadas. Em cada edição do curso poderão funcionar apenas algumas das unidades opcionais, a definir atempadamente. A lista de opções é definida pela comissão coordenadora do curso e aprovada pelas respetivas comissões científicas dos departamentos envolvidos.