Ignorar Comandos do Friso
Saltar para o conteúdo principal
Portal UMinho

Detalhe do evento




Portal UMinho > PT > Comunidades e Redes > Detalhe do evento

 Detalhe do evento

Voltar

Tecnologia portuguesa acelera estudos na saúde e reduz custos

Fotos
João Paulo Tiago
Gráfico
sexta-feira, 07/08/2020
Braga e Lisboa
João Paulo Tiago
Os investigadores João Tiago Paulo (INESC TEC/UMinho), Vinicius Vielmo Cogo e Alysson Neves Bessani (ambos da ULisboa) criaram uma tecnologia que pode permitir estudos mais rápidos e baratos na sequenciação de genomas e com menos 75% de espaço de armazenamento em dados. O estudo foi publicado na "IEEE".

Combinaram uma nova técnica de deduplicação de dados baseados em semelhanças e padrões encontrados nos ficheiros de sequenciação de genomas humanos e uma codificação das alterações para a recuperação desses dados. O inovação desta abordagem é substituir a descrição completa dos dados genómicos sequenciados por pequenos apontadores descrevendo-se apenas alterações necessárias para a recuperação dos dados originais, reduzindo-se consequentemente o espaço necessário e o custo de armazenamento.

Hospitais e biobancos conseguem assim economizar no armazenamento dos dados e, em paralelo, os investigadores podem ler os dados de forma mais rápida. Estas instituições são responsáveis por guardar e distribuir milhões de amostras biológicas para investigadores de todo o mundo e estão sob pressão para armazenar também dados genómicos sequenciados a partir destas amostras, logo estas poupanças terão um impacto significativo no seu quotidiano.

A aplicação em infraestruturas que já usam algoritmos de compressão genéricos nestes dados beneficiam de uma redução adicional de custo e espaço de armazenamento de cerca de 22% e permite que os investigadores acedam aos dados até cinco vezes mais rapidamente. No futuro próximo, os investigadores pretendem disponibilizar a solução em código aberto, melhorar os resultados através de estudos mais aprofundados sobre os padrões e adaptar as conclusões para a sequenciação de genomas de outras espécies.

+Info: www.inesctec.pt/en/people/joao-tiago-paulo, www.di.fc.ul.pt/~bessani/publications/tc20-genodedup.pdf
visao.sapo.pt/exameinformatica/noticias-ei/ciencia-ei/2020-08-05-tecnologia-portuguesa-acelera-e-reduz-custos-de-estudos-na-saude
  • Universidade do
    Minho
  • Largo do Paço
    4704-553 Braga
  • T.:253 601 100, 253 601 109
    E.: gcii@reitoria.uminho.pt
© Universidade do Minho - 2024