A Engenharia Biológica é a integração das Ciências Naturais e das Ciências de Engenharia com vista à aplicação industrial de organismos, células, partes de células e seus constituintes moleculares para a obtenção de produtos e serviços. Visa formar "Engenheiros de Processo” com uma forte componente em Engenharia Química para indústrias onde predominem os processos biológicos, químicos ou físico-químicos, nos domínios da biotecnologia, bioengenharia e bionanotecnologia.
A formação combina adequadamente aspetos teóricos e práticos. Tem um tronco comum até ao 3.º ano (1.º ciclo), com obtenção de um diploma de ciências de engenharia biológica (Licenciatura). Os 5 anos permitem a obtenção do título de Mestre em Engenharia Biológica. Os dois últimos anos oferecem duas alternativas de especialização: "Tecnologia Química e Alimentar", onde é posta ênfase no domínio alimentar (conceção e otimização de processos, novos produtos, qualidade e segurança) e “Tecnologia do Ambiente", centrada no tratamento de efluentes e gestão de resíduos e também nos sistemas de gestão ambiental.
Existem muitas razões para optar pela Engenharia Biológica como curso: satisfação e autonomia profissional, cultura científica e tecnológica, variedade de oportunidades de carreira, boa empregabilidade, atualidade, trabalho estimulante, desenvolvimento intelectual e pensamento criativo.
Espera-se que o Engenheiro Biológico seja capaz de demonstrar criatividade, atitude pró-ativa, capacidade de comunicação, liderança e empreendedorismo, capacidade de trabalho em equipa e em rede, consciência de cidadania e atuação ecossustentável.