A Universidade do Minho tem 32 Unidades de Investigação (UIs), dos quais 11 foram classificados na última avaliação promovida pela Fundação para a Ciência e tecnologia (FCT), recorrendo a Painéis de avaliação Internacionais, como Excecionais (1) ou Excelentes (10). Nestes centros trabalham mais de 40% dos investigadores da UMinho. A Universidade tem ainda 11 Unidades de Investigação classificadas como Muito Bons, significando que mais de 60% dos investigadores da UMinho trabalham em UIs Muito Bons, Excelentes ou Excecionais, abrangendo as áreas de Ciências Exatas, Ciências Naturais, Ciências da Saúde, Ciências da Engenharia e Tecnologias, Ciências Sociais, Artes e Humanidades.